Adunarea Generală - este autoritatea supremă de decizie a Federaţiei. AG include toţi membri activi ai Federaţiei, iar fiecare organizaţie membră are dreptul de vot în Adunare.
Consiliul Director - este autoritatea de conducere în Federaţie şi este format din 7 membri aleşi de AG-un preşedinte, un vice-preşedinte şi 5 membri.
Directorul Executiv - coordonează echipa executivă FOND şi asigură desfăşurarea activităţilor curente.